В настоящее время через навоийский аэропорт осуществляется около 80 рейсов в неделю по направлениям Сеул, Милан, Брюссель, Сарагоса, Франкфурт, Бангкок, Дели, Мумбай, Дакка, Стамбул, а с июня 2009 года по июль 2011 года выполнен 1831 рейс и перевезено свыше 90 тыс. тонн грузов